استقرار نرم افزار عبارت از فعالیت هایی می باشد تا در نهایت منجر به استفاده نهایی نرم افزار با حداکثر میزان انطباق با نیاز های مشتری در چهارچوب استانداری مالی رایج و همینطور رویه های موجود در نرم افزار گردد.
به تجربه ثابت شده است علیرغم آموزش های ارائه شده به کاربران، با توجه به جامعیت نرم افزاری های یکپارچه و عدم شناخت کافی کاربران از تمام امکانات سیستم و فرایند های پیش بینی شده در آن و در بعضی مواقع حتی عدم شناخت و تجربه کافی کاربران از سیستم های مالی و فرایند های موسسه و همینطور محدودیت های موجود در سیستم های نرم افزاری در عمل استقرار سیستم های مالی همواره با چالش های فراوان و صرف زمان زیاد روبرو بوده و در نهایت و صرف هزینه های زیاد منجبر به استفاده کامل و صحیح از نرم افزار ها نمی گردد.
در راهاندازي و استقرار سیستم های یکپارچه مالی تلاش می شود تا فرآيندهاي جاری درسازمان با ملاحظه استاندارد های مالی با فرایند های از پیش طراحی شده در نرم افزار یکپارچه مالی انطباق داده شده، اطلاعات موجود در سازمان و نرم افزاری های قبلی گرداوری و بعد از پالایش آماده ورود به بانک های اطلاعاتی جدید گردد. در کنار این فعالیت ها نقش های کارشناسان سازمان مورد بررسی قرار گرفته و در قالب کاربران نرم افزار و در سطوح دسترسی مختلف اقدام به تحویل قدم به قدم نرم افزار به ایشان می گردد.